分子蒸餾儀是一種特殊的液-液分離技術。在高真空下，蒸汽分子的平均自由程大于蒸發表面和冷凝表面之間的距離，因此液體混合物可以通過使用進料液體中各成分的蒸發速率差來分離。
分子蒸餾儀的工作原理：
沸騰膜和冷凝表面之間的壓差是蒸汽流動方向的驅動力，較小的壓降將導致蒸汽流動。1mbar的操作要求沸騰表面和冷凝表面之間的距離較短。基于此原理制成的蒸餾器稱為短程蒸餾器。短程蒸餾器有一個與加熱表面相對的內置冷凝器，可將工作壓力降至0.001mbar。
分子蒸餾儀的優點：
1、工作溫度低，真空度高，加熱時間短(秒)，分離效率高，特別適用于高沸點、熱敏性和易氧化物質的分離；
2、能有效去除混合物中的低分子物質(除臭)、重分子物質(脫色)和雜質；
3、分離過程是物理分離過程，可以保護分離出的物質免受污染，特別是保持天然提取物的原始質量；
4、分離度高于傳統蒸餾和普通薄膜蒸發器；
5、為了分離高沸點、熱敏性和易氧化材料，分子蒸餾提供了一種分離方法。因為分子蒸餾在遠低于材料沸點的溫度下操作，并且材料的停留時間短；
6、分子蒸餾可以非常有效地從液體中去除有機溶劑和氣味等物質，這是溶劑萃取后液體去溶劑化的非常有效的方法；
7、分子蒸餾可以選擇性地蒸餾出目標產物，去除其他雜質，通過多級分離同時分離兩種以上物質；
8、分子蒸餾的分餾過程是一個物理過程，因此可以保護分離的物質免受污染和入侵。
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